Przy podejrzeniu niepłodności idiopatycznej warto wykonać kompleksowy zestaw badań u obojga partnerów, aby wykluczyć wszystkie możliwe przyczyny trudności z poczęciem. U kobiety zaleca się ocenę owulacji, oznaczenie poziomu hormonów (m.in. AMH w celu określenia rezerwy jajnikowej) oraz badania obrazowe pozwalające sprawdzić drożność jajowodów i budowę macicy – takie jak HyCoSy, histeroskopia lub laparoskopia, jeśli istnieją wskazania. U mężczyzny podstawowym badaniem jest analiza nasienia. W niektórych przypadkach lekarz może także zlecić dodatkowe testy, np. immunologiczne lub genetyczne. Dopiero po wykonaniu tych badań i wykluczeniu innych przyczyn można rozpoznać niepłodność idiopatyczną².